Substitusjonsbehandling ved lavt stoffskifte godkjennes vanligvis, se Stoffskiftesykdommer . Det forutsetter at stoffskiftet er normalt, kontrolleres hos behandlende lege og at dosering har vært uendret i minst 3 måneder. Godkjente preparater er blant annet Euthyrox, Levaxin og Liothyronin.

Behandling ved høyt stoffskifte godkjennes ikke, se Stoffskiftesykdommer. Dette gjelder for eksempel ved bruk av Neo-Mercazole.